2012年2月18日土曜日

Cytoscapeであそぶ

wikipediaの複雑ネットワークに載っていたランダムネットワークがかっこよくみえたので同じような図をつくってみました.

作り方あってるかな・・・

キャプション通りにCytoscapeのRandomNetworksプラグインを利用する.

プラグインが見当たらない場合は[Manage Plugins]からインストールすること.


RandomNetworksプラグインを起動する.

[Plugins]>[Random Networks]>[Generate Random Network]を選択する.

Barabasi-Albert Modelを選択して[Next].

ノード数に「1000」と入力して,[Generate]ボタンをクリック.


ランダムネットワークが生成された.


適当にレイアウトする.


Network Analysisプラグインを起動して,


ノードサイズを入次数と対応させる.


それっぽくなってきた.(ノード数が多いけど)



あとは色づけして完成.


部分的に拡大するとこんな感じ.



かっこいいだけじゃなくて,ちゃんと勉強しなきゃね.

今日は息抜きということで.